物理、化學為科技產業發展的基礎，不論是純理論、或應用研究，都有很多發揮空間。
現代高科技產業發展，與基礎科學息息相關。如同交通大學電子物理系所主任陳振芳所說：「沒有量子力學，就沒有固態物理；沒有固態物理，也就沒有今天的半導體產業、光電科技，和新興的奈米科技。」
在應用科技發展蓬勃之際，基礎科學的研究，卻也產生逐漸向應用端靠攏的現象。光電、奈米、生技、製藥等相關應用研究，在這個跨領域研究盛行的時代，正是物理、化學領域熱門的研究範疇。
然而，基礎理論的研究仍為尖端科技發展之母。台灣大學物理學研究所所長熊怡說：「尖端科技研究原本就是由唇科學研究發展出來，因此不能偏廢基礎理論的研究。例如網際網路的發明，就是源自於瑞士日內瓦的粒子物理研究中心，由粒子傳送現象中，發展出WWW、email等網際網路工具。」
物理、化學為科技產業發展的基礎，因此不論是純理論，或應用研究，都有很多發揮空間。
「以興趣為主，研究做的好最重要」，是多位物理、化學研究所長，對有志於基礎科學研究所的學生，選擇領域時的誠摯建議。
交大物理納入生物科技，成大兼容並蓄
交大電子物理研究所，分成電子物理組、及光電與奈米科學組。前者著重在半導體、凝態、理論物理和電子科學的研究，後者則側重於奈米與光電物理的相關研究。
陳振芳說，交大的研究重點在光電、奈米科技、半導體物理與元件、凝態與理論物理等4個領域。並與校內其他相關系所如光電工程所、材料科學與工程所、生物科技所等合作頻繁，近年積極推動包括奈米生物技術研發、液晶材料物理研究、非線性光學及光通訊與光通訊元件探討等前瞻性的跨領域研究。
此外，該所近年有老師投入十分尖端的生物科技領域，進行雷射聶子、生物晶片的技術研究。陳振芳補充：「電子物理與生物科技結合，也是交大電物所近年新發展的研究領域。」
成立於民國36年，成功大學物理學系堪稱國內最老資格的物理系之一。成大物理研究所長盧炎田說，該所的特色在於系大、歷史悠久，因此各方面的研究領域齊全，包括了高能、光電、天文、原子分子物理等領域；而國科會國家理論中心南部中心就設在成大，所以成大物理系也雇用了兩位訪問學者長駐理論中心，共同進行關於計算物理、量子物理的研究。
清大、台大朝「一系多所」發展
清華大學以理工科起家，而清大物理研究所的研究領域遍及了原子分子物理、高能物理、天文物理、凝態物理、微波(電漿)物理、光電物理等。
清大物理系系主任郭瑞年說，清大物理現階段的規劃是朝「一系多所」的方向，除了物理研究所、及已於民國90年成立的天文研究所以外，針對國內目前非常熱門的光電領域，清大物理系正計畫設立光電物理研究所，最快3年內可以開始招生。
郭瑞年指出，光電物理是物理領域中一門基礎學門，從基礎理論到應用面都有很多空間可以發展，而該所光電相關師資至少有10位之多，因此成立光電物理研究所是勢在必行。
台灣大學物理系，也正朝一系多所的方向規劃中。熊怡表示，台大物理系正在籌備設立應用物理研究所，最快可能於明年開始招生，研究領域將偏重在凝態物理、及生物物理；而現有的物理學研究所，將持續專注在基礎物理、粒子物理、高能物理、原子核子物理等範疇；至於已成立5年的天文物理學研究所，研究重點則在天文物理、宇宙學觀測等。
化學所製藥、生技、奈米研究為主流
高雄大學應用化學系成立於民國90年，碩士班則於去年成立，課程規劃著眼於化學在產業應用的銜接性，並反映在師資聘用上。高大應化系專任教師中，近8成有過工業經驗(如台積電、工研院、中油等)，超過一半以上曾有專利發表。
高大應化系所主任張夢揚表示，該所課程規劃為綠色永續化學、材料化學、及環境藥物合成與分析化學等3大應用領域。他分析，化學研究與製藥、半導體科技結合，是未來5年趨勢。
中興化學系主任李茂榮分析「生物科技」及「奈米材料」視台灣本世紀的重點發展產業，所以國內化學所近年的研究重點亦在生醫與奈米科技。而化學研究已由過去的「巨觀」現象探討，延伸至「微觀」研究，甚至是針對單一分子性質的觀察與應用；奈米科技相關研究，就是微觀研究的實例。他強調，未來的化學研究將持續以微觀研究為主流。
至於淡江大學化學研究所的研究方向則以「材料化學」與「生物化學」為兩大主軸。材料化學可分為液晶材料、電子材料與無機磁性材料、超導材料、及材料相關之分子模擬為主要項目；生物化學則以藥物化學、血型轉移等研究為主。
淡江化學系系主任王伯昌分析：「國內化學研究中，以傳統化學研究如：化學動力學、統計力學、有機合成、分析化學等領域較為沒落，而藥物合成、電子材料等應用範疇，則是教授重視的領域。」
※資料來源：2008年最佳研究所指南 天下雜誌/CHEERS
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